Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLX3O43711 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TLX3O43711 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLX3O43711 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLX3O43711 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLX3O43711 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLX3O43711 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLX3O43711 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLX3O43711 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLX3O43711 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLX3O43711 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLX3O43711 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLX3O43711 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLX3O43711 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLX3O43711 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLX3O43711 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLX3O43711 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLX3O43711 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLX3O43711 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLX3O43711 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLX3O43711 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLX3O43711 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLX3O43711 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLX3O43711 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLX3O43711 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLX3O43711 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLX3O43711 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLX3O43711 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLX3O43711 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLX3O43711 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLX3O43711 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLX3O43711 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLX3O43711 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLX3O43711 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLX3O43711 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLX3O43711 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLX3O43711 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLX3O43711 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLX3O43711 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLX3O43711 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLX3O43711 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLX3O43711 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLX3O43711 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLX3O43711 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLX3O43711 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLX3O43711 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLX3O43711 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLX3O43711 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLX3O43711 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLX3O43711 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLX3O43711 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLX3O43711 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLX3O43711 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLX3O43711 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLX3O43711 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLX3O43711 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLX3O43711 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLX3O43711 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLX3O43711 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLX3O43711 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLX3O43711 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms