Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERI3O43414 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERI3O43414 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERI3O43414 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERI3O43414 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERI3O43414 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERI3O43414 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERI3O43414 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERI3O43414 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERI3O43414 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERI3O43414 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERI3O43414 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERI3O43414 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERI3O43414 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERI3O43414 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERI3O43414 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERI3O43414 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERI3O43414 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERI3O43414 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERI3O43414 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERI3O43414 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERI3O43414 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERI3O43414 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERI3O43414 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERI3O43414 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERI3O43414 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERI3O43414 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERI3O43414 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERI3O43414 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERI3O43414 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERI3O43414 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERI3O43414 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERI3O43414 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERI3O43414 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERI3O43414 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERI3O43414 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERI3O43414 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERI3O43414 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERI3O43414 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERI3O43414 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERI3O43414 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERI3O43414 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERI3O43414 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERI3O43414 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERI3O43414 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERI3O43414 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERI3O43414 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERI3O43414 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERI3O43414 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERI3O43414 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERI3O43414 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERI3O43414 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms