Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF3O43395 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRPF3O43395 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF3O43395 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF3O43395 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF3O43395 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF3O43395 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF3O43395 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF3O43395 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF3O43395 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF3O43395 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF3O43395 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRPF3O43395 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRPF3O43395 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF3O43395 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF3O43395 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF3O43395 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF3O43395 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRPF3O43395 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF3O43395 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRPF3O43395 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF3O43395 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF3O43395 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF3O43395 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF3O43395 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF3O43395 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms