Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASA4O43374 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASA4O43374 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASA4O43374 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASA4O43374 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASA4O43374 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASA4O43374 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASA4O43374 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASA4O43374 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASA4O43374 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASA4O43374 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASA4O43374 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASA4O43374 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASA4O43374 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASA4O43374 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASA4O43374 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASA4O43374 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASA4O43374 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASA4O43374 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASA4O43374 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASA4O43374 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RASA4O43374 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASA4O43374 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASA4O43374 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASA4O43374 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASA4O43374 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASA4O43374 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASA4O43374 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RASA4O43374 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASA4O43374 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASA4O43374 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASA4O43374 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASA4O43374 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASA4O43374 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASA4O43374 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASA4O43374 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASA4O43374 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASA4O43374 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASA4O43374 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASA4O43374 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASA4O43374 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASA4O43374 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASA4O43374 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASA4O43374 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASA4O43374 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASA4O43374 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASA4O43374 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASA4O43374 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASA4O43374 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASA4O43374 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASA4O43374 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASA4O43374 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASA4O43374 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASA4O43374 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASA4O43374 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASA4O43374 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASA4O43374 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASA4O43374 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASA4O43374 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASA4O43374 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASA4O43374 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASA4O43374 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASA4O43374 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASA4O43374 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASA4O43374 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASA4O43374 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASA4O43374 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RASA4O43374 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASA4O43374 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASA4O43374 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RASA4O43374 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASA4O43374 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASA4O43374 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASA4O43374 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASA4O43374 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASA4O43374 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASA4O43374 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms