Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATMINO43313 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMINO43313 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATMINO43313 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATMINO43313 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATMINO43313 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMINO43313 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMINO43313 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMINO43313 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMINO43313 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMINO43313 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMINO43313 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMINO43313 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATMINO43313 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATMINO43313 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATMINO43313 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATMINO43313 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATMINO43313 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMINO43313 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMINO43313 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMINO43313 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMINO43313 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATMINO43313 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATMINO43313 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATMINO43313 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATMINO43313 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATMINO43313 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMINO43313 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMINO43313 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMINO43313 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMINO43313 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMINO43313 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMINO43313 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMINO43313 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMINO43313 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMINO43313 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMINO43313 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMINO43313 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMINO43313 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMINO43313 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMINO43313 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMINO43313 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMINO43313 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMINO43313 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMINO43313 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMINO43313 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMINO43313 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMINO43313 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMINO43313 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATMINO43313 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATMINO43313 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATMINO43313 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATMINO43313 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATMINO43313 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATMINO43313 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATMINO43313 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATMINO43313 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATMINO43313 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATMINO43313 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATMINO43313 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATMINO43313 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATMINO43313 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATMINO43313 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATMINO43313 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATMINO43313 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATMINO43313 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATMINO43313 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms