Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SRGAP3O43295 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SRGAP3O43295 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP3O43295 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms