Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 513.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-214ENST00000488242 789 ntTSL 511.51□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-213ENST00000486164 781 ntTSL 310.99□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 510.24□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 29.14□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 58.37□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 56.64□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 GGT1-213ENST00000425895 2632 ntTSL 211.8□□□□□ -0.522e-15■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.041e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.371e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 36.27□□□□□ -1.411e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 MAP4-216ENST00000633710 570 ntTSL 53.81□□□□□ -1.81e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 TNFRSF1B-202ENST00000489921 409 ntTSL 314.62□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 37.3
RBFOX2O43251 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 CDK3-203ENST00000586261 803 ntTSL 511.25□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 AMT-208ENST00000462048 546 ntTSL 49.2□□□□□ -0.943e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 AMT-207ENST00000461210 850 ntTSL 26.79□□□□□ -1.323e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 514.99□□□□□ -0.012e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 513.75□□□□□ -0.212e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 513.53□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 512.61□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 310.97□□□□□ -0.652e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 58.34□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 212.42□□□□□ -0.424e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.64e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.644e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.644e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-201ENST00000307364 2586 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.674e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.74e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.74e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.744e-11■■■■■ 37.2
RBFOX2O43251 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 37.1
RBFOX2O43251 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 37.1
RBFOX2O43251 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 37.1
RBFOX2O43251 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 37.1
RBFOX2O43251 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 37
RBFOX2O43251 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 37
RBFOX2O43251 PTK2B-202ENST00000397497 3161 ntTSL 210.7□□□□□ -0.74e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.854e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.054e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.184e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.184e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 PTPRF-211ENST00000467464 571 ntTSL 39.06□□□□□ -0.966e-8■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.532e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 NPHP3-203ENST00000465756 3852 ntTSL 58.58□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 NPHP3-208ENST00000490993 5197 ntTSL 56.17□□□□□ -1.422e-10■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 POLE-220ENST00000544692 2221 ntTSL 517.48■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 36.9
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RBFOX2O43251 POLE-211ENST00000538196 551 ntTSL 49.69□□□□□ -0.861e-9■■■■■ 36.9
RBFOX2O43251 MPRIP-209ENST00000466186 880 ntTSL 512.95□□□□□ -0.344e-10■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-215ENST00000474353 2906 ntTSL 27.75□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.361e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 MAGI1-203ENST00000460329 3694 ntTSL 511.24□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 MAGI1-204ENST00000463103 4193 ntTSL 510.75□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.554e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.694e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-216ENST00000454226 593 ntTSL 310.57□□□□□ -0.724e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.754e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-217ENST00000479336 846 ntTSL 310.17□□□□□ -0.784e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.84e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-214ENST00000451082 803 ntTSL 59.33□□□□□ -0.924e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.954e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-218ENST00000628415 3287 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.994e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-219ENST00000636016 6665 ntTSL 28.72□□□□□ -1.014e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.294e-12■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 35.92□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 216.12■□□□□ 0.177e-8■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 CYB5B-203ENST00000514123 2492 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.932e-20■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.932e-20■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-20■■■■■ 36.8
RBFOX2O43251 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.442e-20■■■■■ 36.8
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