Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD3O43242 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD3O43242 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms