Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHGDHO43175 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHGDHO43175 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms