Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP8O43159 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP8O43159 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP8O43159 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP8O43159 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP8O43159 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP8O43159 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP8O43159 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP8O43159 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP8O43159 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP8O43159 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP8O43159 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP8O43159 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP8O43159 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP8O43159 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP8O43159 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP8O43159 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP8O43159 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP8O43159 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP8O43159 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP8O43159 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP8O43159 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP8O43159 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP8O43159 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP8O43159 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP8O43159 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP8O43159 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RRP8O43159 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP8O43159 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP8O43159 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP8O43159 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP8O43159 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP8O43159 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP8O43159 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP8O43159 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP8O43159 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP8O43159 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP8O43159 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP8O43159 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP8O43159 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP8O43159 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP8O43159 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP8O43159 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP8O43159 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP8O43159 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP8O43159 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP8O43159 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP8O43159 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms