Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZZEF1O43149 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZZEF1O43149 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZZEF1O43149 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms