Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2DO15514 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2DO15514 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms