Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC22A1O15245 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A1O15245 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A1O15245 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A1O15245 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A1O15245 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms