Protein–RNA interactions for Protein: O15118

NPC1, Niemann-Pick C1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1O15118 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1O15118 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1O15118 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1O15118 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1O15118 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1O15118 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1O15118 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1O15118 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1O15118 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1O15118 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1O15118 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1O15118 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1O15118 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1O15118 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1O15118 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1O15118 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1O15118 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1O15118 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1O15118 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1O15118 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1O15118 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1O15118 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1O15118 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1O15118 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1O15118 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1O15118 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1O15118 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1O15118 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1O15118 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1O15118 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPC1O15118 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPC1O15118 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1O15118 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1O15118 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1O15118 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1O15118 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms