Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
SETD1AO15047 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETD1AO15047 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms