Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF5O14894 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF5O14894 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF5O14894 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms