Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FFAR3O14843 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FFAR3O14843 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FFAR3O14843 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms