Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME4O00746 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME4O00746 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME4O00746 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME4O00746 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME4O00746 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME4O00746 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME4O00746 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME4O00746 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME4O00746 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME4O00746 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME4O00746 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME4O00746 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME4O00746 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME4O00746 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME4O00746 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME4O00746 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME4O00746 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME4O00746 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME4O00746 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME4O00746 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME4O00746 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME4O00746 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME4O00746 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME4O00746 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME4O00746 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME4O00746 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME4O00746 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME4O00746 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME4O00746 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME4O00746 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NME4O00746 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME4O00746 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME4O00746 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME4O00746 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms