Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F3O00716 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F3O00716 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F3O00716 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F3O00716 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F3O00716 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F3O00716 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F3O00716 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F3O00716 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F3O00716 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F3O00716 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F3O00716 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F3O00716 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F3O00716 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F3O00716 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F3O00716 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F3O00716 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F3O00716 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F3O00716 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F3O00716 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F3O00716 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F3O00716 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F3O00716 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F3O00716 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F3O00716 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F3O00716 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F3O00716 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F3O00716 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F3O00716 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F3O00716 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F3O00716 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F3O00716 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F3O00716 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F3O00716 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F3O00716 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F3O00716 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F3O00716 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F3O00716 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F3O00716 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F3O00716 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F3O00716 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F3O00716 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F3O00716 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F3O00716 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F3O00716 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F3O00716 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F3O00716 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F3O00716 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F3O00716 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F3O00716 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F3O00716 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F3O00716 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F3O00716 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F3O00716 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F3O00716 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms