Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX7O00628 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX7O00628 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PEX7O00628 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX7O00628 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX7O00628 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX7O00628 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX7O00628 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX7O00628 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX7O00628 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX7O00628 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX7O00628 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX7O00628 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX7O00628 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX7O00628 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX7O00628 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX7O00628 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX7O00628 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX7O00628 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX7O00628 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PEX7O00628 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PEX7O00628 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PEX7O00628 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX7O00628 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX7O00628 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX7O00628 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX7O00628 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX7O00628 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX7O00628 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX7O00628 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX7O00628 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms