Protein–RNA interactions for Protein: O00459

PIK3R2, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R2O00459 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R2O00459 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3R2O00459 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3R2O00459 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms