Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
I3L3M4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
I3L3M4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
I3L3M4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
I3L3M4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
I3L3M4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
I3L3M4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
I3L3M4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
I3L3M4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms