Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX16-NPEPL1H3BU86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms