Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8VP50 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8VP50 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8VP50 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8VP50 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
F8VP50 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F8VP50 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F8VP50 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F8VP50 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F8VP50 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
F8VP50 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
F8VP50 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8VP50 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8VP50 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8VP50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8VP50 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8VP50 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8VP50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8VP50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8VP50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8VP50 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8VP50 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8VP50 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8VP50 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8VP50 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8VP50 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8VP50 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8VP50 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8VP50 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
F8VP50 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
F8VP50 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8VP50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
F8VP50 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8VP50 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8VP50 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8VP50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8VP50 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8VP50 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8VP50 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8VP50 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8VP50 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8VP50 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8VP50 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8VP50 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8VP50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8VP50 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8VP50 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F8VP50 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F8VP50 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F8VP50 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
F8VP50 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F8VP50 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
F8VP50 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
F8VP50 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F8VP50 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
F8VP50 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F8VP50 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F8VP50 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F8VP50 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F8VP50 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F8VP50 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F8VP50 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F8VP50 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F8VP50 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F8VP50 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F8VP50 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F8VP50 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F8VP50 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
F8VP50 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F8VP50 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F8VP50 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F8VP50 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F8VP50 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms