Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRM5B3KS81 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms