Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1CA8MV81 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms