Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL3A8MV65 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms