Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOBPA7XYQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOBPA7XYQ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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