Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF316A6NFI3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF316A6NFI3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms