Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMCO2A6NFE2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMCO2A6NFE2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMCO2A6NFE2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms