Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIT2A6NDA9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIT2A6NDA9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIT2A6NDA9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIT2A6NDA9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIT2A6NDA9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIT2A6NDA9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIT2A6NDA9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIT2A6NDA9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIT2A6NDA9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms