Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37CA5D8V6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS37CA5D8V6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 638.8 ms