Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD3A2A2Y4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMD3A2A2Y4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms