Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LNP1A1A4G5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms