Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV5S2A0A599 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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