Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX20

TRBV7-6, T-cell receptor beta variable 7-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-6A0A0J9YX20 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-6A0A0J9YX20 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-6A0A0J9YX20 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms