Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JN53

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0G2JN53 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0G2JN53 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0G2JN53 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0G2JN53 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms