Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1C5

CYP2D7, Putative cytochrome P450 2D7, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2D7A0A087X1C5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP2D7A0A087X1C5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP2D7A0A087X1C5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2D7A0A087X1C5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP2D7A0A087X1C5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2D7A0A087X1C5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms