Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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