Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms