Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms