Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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