Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms