Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms