Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP2BPQ9P2M1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms