Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L2Q9P2F8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L2Q9P2F8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms