Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms