Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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