Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms