Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms